|
| |
|
|
Ověření dědičnosti markerů mikrosatelitového panelu u velbloudů
Grygarová, Tereza
Diplomová práce se zabývá ověřením dědičnosti vybraných mikrosatelitů z panelu mikrosatelitů z oblasti MHC u velbloudů. Teoretická část se věnuje charakteristice rodu Camelus. Zejména pak adaptačním mechanismům umožňujícím velbloudům přežívat v podmínkách, které jsou pro jiná hospodářská zvířata nehostinná. Popsány jsou i mikrosatelity, které se staly výbornou volbou nejen v analýze dědičnosti. Praktická část byla založena na fragmentační analýze v přístroji ABI PRISM 3500, které předcházela izolace DNA, multiplex PCR amplifikace mikrosatelitových lokusů a elektroforetické ověření na gelu. Pomocí programu GeneMapper 5 byly vypočítány velikosti amplifikovaných fragmentů, určeny genotypy a ověřena mendelistická segregace. K ověření dědičnosti mikrosatelitového panelu byly vybrány čtyři mikrosatelitové markery, a to M29_I, M35_II, M41_III a M42_III. Nejméně polymorfním byl mikrosatelit M29_I z oblasti MHC I a nejvíce polymorfním byl mikrosatelit M42_III z oblasti MHC III. Obecně lze mikrosatelity z mikrosatelitového panelu považovat za spolehlivé pro ověření původu alel a mohou být dále použity k odhalení polymorfismu MHC oblasti velbloudů.
|
|
|
Studium časné kancerogeneze u spinoceluárního karcinomu hlavy a krku.
Kastner, Jan ; Betka, Jan (vedoucí práce) ; Salzman, Richard (oponent) ; Smilek, Pavel (oponent)
Spinocelulární karcinom hlavy a krku (HNSCC, head and neck squamous cell carcinoma) je nejčastějším zhoubným nádorem ORL oblasti. Prognostické a prediktivní informace, získané na podkladě molekulárně genetického rozboru procesu kancerogeneze u HNSCC, jsou nezbytné pro zhodnocení a individualizaci léčby i výběr optimální léčebné modality. A v případě chirurgického výkonu i optimální resekce tumoru s cílem dosáhnout co nejlepší kvality života a nejdelšího přežití. Studium časné kancerogeneze (nebo též karcinogeneze) je založeno na poznání, že histologicky normální tkáň v okolí nádoru vykazuje na molekulární úrovni preneoplastické změny. Molekulárně genetické změny v histologicky normální tkáni přilehlé k nádoru tak mohou hrát zásadní roli při ozřejmění procesu kancerogeneze. Disertační práce shrnuje současné poznatky o časné kancerogenezi u spinocelulárního karcinomu hlavy a krku a uvádí molekulárně biologické trendy, které mohou přispět k detailnějšímu poznání časné fáze kancerogeneze u tohoto typu karcinomu a tím i zlepšit detekci, výhledově pak i léčbu tohoto zhoubného onemocnění. Nosným tématem práce je detekce mikrosatelitních lézí pomocí fragmentační analýzy ve tkáni nádorové, ve tkáních nenádorových v blízkosti nádoru a ve tkáni dostatečně vzdálené od nádoru. Výsledky práce přispívají k potvrzení...
|
|
|
Population biology of the pine needle pathogen Lecanosticta acicola (Thüm.) Syd. (Capnodiales, Ascomycota)
Janoušek, Josef
Lecanosticta acicola je vřeckovýtrusá heterotalická houba, která způsobuje hnědou sypavku borového jehličí na původních i nepůvodních borovicích v mnoha oblastech světa. Cílem této dizertační práce bylo objasnění původu populací L. acicola v Evropě a zjištění způsobu rozmnožování tohoto patogenu v zasažených oblastech. Jedenáct polymorfních mikrosatelitových markérů bylo vyvinuto pro jejich použití v populační genetice. 'Mating type' markéry, které amplifikují obě 'mating type' idiomorfy (MAT1-1 and MAT1-2), byly také navrženy a protokol pro jejich aplikaci byl optimalizován. Infikované jehlice byly získány ze 17 druhů borovic z Asie, Evropy a Ameriky. V součtu, 201 izolátů L. acicola bylo získáno z infikovaných jehlic borovic. Všechny izoláty byly charakterizovány pomocí mikrosatelitových markérů a 'mating type' idiomorfa byla určena pomocí 'mating type' markérů. Část Translation Elongation Factor 1-alfa genu byla sekvenována u 87 jedinců. Izoláty ze Střední Ameriky byly jedinečné, velmi různorodé a velmi pravděpodobně představují kryptické druhy. Izoláty z východní Asie vytvořili oddělenou skupinu. Dvě odlišné populace byly zjištěny jak v Severní Americe, tak v Evropě. Analýzy využívající koncept 'approximate Bayesian computation' zřetelně ukázaly, že v minulosti došlo k nezávislým introdukcím obou populací ze Severní Ameriky do Evropy. Z dat získaných z mikrosatelitů a 'mating type' markérů bylo zjištěno, že k pohlavnímu rozmnožování dochází jak v Severní Americe, tak v Evropě. Výsledky této dizertační práce ukázaly, že evropské populace L. acicola mají původ v Severní Americe. Toto je první studie populací L. acicola v globálním měřítku.
|
|
|
Ověřování SSR markerů vhodných pro rozlišování odrůd vybraných zelenin z čeledi Brassicaceae
Sochorová, Jana
V literatuře není zatím popsán obecný soubor mikrosatelitních markerů pro testování F1 hybridů při šlechtění více odrůd zelí (Brassica oleracea conv. capitata). Jedná se o odlišení F1 rostlin od samoopylených rostlin s rodičovským genotypem. Proto byly z literatury vybrány mikrosatelitní markery, použité u jiných druhů rodu Brassica a byla studována jejich schopnost rozlišit F1 hybridy u sedmi kultivarů zelí. Dva z 23 studovaných mikrosatelitních markerů byly schopny odlišit F1 hybridy u šesti kultivarů zelí. F1 hybridní rostlina a rodičovské rostliny odrůdy 'A' nebyly rozlišeny pomocí žádného ze studovaných mikrosatelitních markerů.
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.